Pod koniec XX wieku przeprowadzono w prezbiterium kościoła św. Ducha prace badawcze i konserwatorskie. Efekty tych prac pozwoliły na zaaranżowanie w tym wnętrzu wystawy archeologicznej „Odkrycia w kościele ss. dominikanek”. Jest ona prezentacją „in situ” odkryć dokonanych podczas prowadzonych w prezbiterium w latach 1992-1998 badań archeologicznych, uzupełnioną o zabytki pochodzące z badań pod kaplicą św. Dominika oraz pod nawą główną kościoła. Spośród prezentowanych eksponatów na szczególną uwagę zasługuje złamany rytualnie miecz żelazny, znaleziony w grobie ostatniego księcia raciborskiego z rodu Przemyślidów Walentyna (zmarł w 1521 roku).
Na ścianie wschodniej prezbiterium podziwiać można fresk przedstawiający „Zesłanie Ducha Świętego”, którego powstanie datowane jest na  ok. 1635 rok. Malowidło to skomponowane zostało po obu stronach ostrołukowego okna wypełnionego kamiennym, gotyckim maswerkiem.
W prezbiterium wyeksponowane zostały także zachowane wątki ceglane oraz prowadzący do dawnej zakrystii, wczesnogotycki portal kamienny.